Boekhoudsoftware webshop: 5 pakketten vergeleken 2026
Bijgewerkt op 17 juli 2026
Als webshop of e-commerce ondernemer heb je andere eisen aan boekhoudsoftware dan een dienstverlener met een handjevol facturen per maand. Je verwerkt vaak veel kleine bestellingen, moet voorraad bijhouden, hebt te maken met btw over verkopen aan consumenten en soms ook aan andere EU-landen (ICP), en je bankkoppeling moet grote volumes transacties netjes kunnen matchen. Bij deze vergelijking kijken we specifiek naar gebruiksgemak bij hoge transactievolumes, voorraadfunctionaliteit, koppelbaarheid met webshopplatforms en prijs in verhouding tot wat een groeiende webshop nodig heeft. We rangschikken alle vijf pakketten eerlijk, ook als dat betekent dat een populair pakket ergens minder scoort.
Een webshop draait op volume. Waar een consultant tien facturen per maand verstuurt, verwerk jij misschien honderden of duizenden bestellingen, met retouren, verschillende btw-tarieven en betalingen via iDEAL, PayPal of achteraf betalen. Je boekhoudpakket moet die stroom aankunnen zonder dat je elke transactie met de hand hoeft te controleren. Hieronder lees je waar je op let, wat webshops echt nodig hebben en wat de pakketten ongeveer kosten.
Waar let je op bij het kiezen voor een webshop?
Vier dingen wegen voor e-commerce zwaarder dan voor een gemiddelde ondernemer.
Ten eerste de bankkoppeling en transactieherkenning. Bij grote volumes valt of staat je administratie met hoe goed het pakket binnenkomende betalingen automatisch aan de juiste order koppelt. Moneybird en e-Boekhouden.nl zijn hier sterk in, en Jortt automatiseert met zijn boekhoudbot naar eigen zeggen tot 99 procent van de verwerking.
Ten tweede de koppeling met je webshopplatform. Bestellingen uit WooCommerce, Shopify of Lightspeed moeten als factuur of boeking binnenkomen zonder overtikken. Moneybird, e-Boekhouden.nl, Jortt en Exact Online bieden hiervoor koppelingen of API’s.
Ten derde voorraad. Houd je zelf voorraad aan, dan wil je dat je inkoop, verkoop en voorraadwaarde met elkaar kloppen. e-Boekhouden.nl heeft een ingebouwde voorraadmodule en Exact Online gaat nog verder met volwaardige voorraad- en inkoopmodules. Moneybird en Jortt zijn hierin bewust lichter.
Ten vierde btw over EU-verkopen. Verkoop je aan consumenten in andere EU-landen, dan krijg je te maken met de One Stop Shop en met ICP-aangifte voor zakelijke afnemers. Exact Online en SnelStart dienen ICP rechtstreeks in.
Wat een webshop echt nodig heeft
De meeste webshops hebben geen zwaar ERP-systeem nodig. Een vlotte bankkoppeling, een betrouwbare webshopkoppeling en nette btw-afhandeling dekken de dagelijkse realiteit. Verkoop je diensten, digitale producten of doe je aan dropshipping, dan is uitgebreid voorraadbeheer overbodig en ben je met een licht pakket sneller én goedkoper uit.
Het kantelpunt ligt bij fysieke voorraad in eigen beheer en groeiende inkoopstromen. Zodra je met meerdere leveranciers, veel artikelen en inkooporders werkt, wordt een pakket met echte voorraad- en inkoopfunctionaliteit de moeite waard. Onderschat dat kantelpunt niet: te vroeg overstappen op een zwaar pakket kost onnodig geld en tijd, te laat overstappen betekent handmatig gepriegel dat je bij elke order herhaalt.
Veelgemaakte fouten
Kiezen op prijs alleen. Het goedkoopste instaptarief bevat vaak niet de btw-aangifte of de bankkoppeling die je juist nodig hebt. Reken met het tier dat jouw functies dekt, niet met de vanaf-prijs.
Voorraad onderschatten. Veel starters kiezen een licht pakket en lopen een jaar later vast omdat voorraad en inkoop niet kloppen. Denk vooruit over waar je over twaalf maanden staat.
De webshopkoppeling niet testen. Een koppeling die op papier bestaat, is niet altijd de koppeling die naadloos met jouw platform en betaalproviders werkt. Test dit in de gratis proefperiode met echte orders.
Te zwaar beginnen. Een startende webshop heeft zelden Exact Online nodig. Betaal niet voor ERP-functies die maanden ongebruikt blijven.
Prijzen: wat kost het ongeveer?
De verschillen zijn fors, dus reken met het pakket dat jouw functies dekt.
- Moneybird: vanaf 3 euro per maand, maar btw-aangifte zit vanaf het Start-pakket van 15 euro. Groei kost 29 euro, Compleet 41 euro. Vaste prijs, niet per gebruiker.
- e-Boekhouden.nl: een gratis startpakket, daarna vanaf 4,98 euro per maand (actietarief, regulier 9,95 euro). De variant met facturatie, offertes en urenregistratie kost 12 euro per maand.
- Jortt: ZZP vanaf 19,95 euro, MKB met Peppol e-facturatie en iDEAL-betaallink 24,95 euro, Plus 34,95 euro per maand.
- SnelStart: inOrde vanaf 9,50 euro, inStap 15,50 euro, inKaart 22 euro, inBalans met order- en projectbeheer 39,50 euro per maand.
- Exact Online: Essentials vanaf 49 euro, Plus 99 euro, Professional 159 euro en Premium vanaf 299 euro per maand. Duidelijk het duurst, maar ook het meest compleet.
Conclusie
Voor de meeste webshops is een licht tot middelzwaar pakket met een sterke bankkoppeling en goede webshopkoppeling de verstandigste keuze. Draai je op eigen voorraad en groeiende inkoop, dan verdient een pakket met echte voorraadfunctionaliteit zich terug. Bekijk hierboven de genummerde top 5 met de motivatie per tool, gebruik de gratis proefperiode om de webshopkoppeling met echte orders te testen, en kies op basis van wat jouw webshop over een jaar nodig heeft.
- 1
Moneybird
4.6Beste algemene keuze voor de meeste webshops
Moneybird is expliciet geschikt voor webshops, gebruiksvriendelijk en heeft alles wat een gemiddelde webshop nodig heeft: bankkoppeling, scan-herken en soepele facturatie, tegen een vaste prijs vanaf 12 euro per maand. Voor webshops met een complexere administratie, bijvoorbeeld met uitgebreide voorraadadministratie of inkoopprocessen, loopt Moneybird wel tegen zijn grenzen aan.
- 2
Beste keuze als voorraadbeheer belangrijk is
e-Boekhouden.nl is zeer volledig met ingebouwde voorraadmodule, urenregistratie en ICP-aangifte, wat precies is wat een webshop met eigen voorraad en EU-verkopen nodig heeft, en je kunt gratis starten. De interface oogt traditioneler dan bij Moneybird of Jortt, waardoor de leercurve iets hoger ligt.
- 3
Exact Online
4.2Beste keuze voor groeiende webshops met complexe voorraad en inkoop
Exact Online is een compleet boekhoud- en ERP-platform met sterke voorraad- en inkoopmodules, ideaal voor webshops die doorgroeien naar groothandel of productie en veel artikelen en leveranciers beheren. Voor een startende of kleinere webshop is Exact Online vanaf 21 euro per maand echter duurder en complexer dan nodig.
- 4
Jortt
4.3Prettig en modern, maar beperkt voor grotere webshops
Jortt automatiseert de boekhouding grotendeels en heeft een modern gebruiksgemak, wat fijn is voor een kleinere webshop met overzichtelijke administratie. Zodra de administratie complexer wordt, bijvoorbeeld door veel voorraad of grote volumes, is Jortt minder geschikt dan e-Boekhouden.nl of Exact Online.
- 5
SnelStart
4.3Solide facturatie, maar minder toegespitst op e-commerce
SnelStart is betrouwbaar met sterke facturatie en een optionele salarismodule, maar richt zich van oudsher meer op zzp'ers en de bouw dan op webshops met voorraad en hoge ordervolumes. De klassiekere interface en het ontbreken van specifieke webshopgerichte functies maken het voor deze doelgroep de minst voor de hand liggende keuze van de vijf.